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NGS一站式解决方案
发布会时间:2023-10-20 17:39

二代测序(NGS)又称为高通量测序,是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术,该技术用于确定整个基因组或DNA或RNA目标区域中核苷酸的序列。建库测序是指在待测片段两端加上用于测序的接头 (含有 index,barcode,测序引物结合序列等),然后通过测序仪测序的过程。靶向测序是将目的基因或目的区域捕获出来后测序,主要方法有杂交捕获和多重PCR两种。


bevictor伟德官网入口NGS优势

★ 接头,blocker捕获探针panel可以定制+设计,解决市面通用的接头,blocker,成品panel不能满足项目需要的痛点。

★ 提供靶向捕获测序一整套原料试剂:捕获探针设计、捕获探针/多重PCR引物合成、建库试剂、杂交捕获试剂捕获。解决NGS原料由多家供应商采购导致的试剂不兼容问题。

★ bevictor伟德官网入口除了提供一整套原料试剂、还可根据客户需求定制生信分析方法/流程。

★ bevictor伟德官网入口NGS整体解决方案支持illumina和MGI两种测序平台。




NGS服务选择

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捕获探针panel设计

客户提供bed文件或者fasta格式文件,bevictor伟德官网入口可以根据客户需求定制化设计。

探针设计一般参数过滤:gc、mask、Tm

Blast映射过滤:使用Blast 工具将所有baits 回贴至基因组,并且将比对结果进行归类,将探针按照特异性高到低分为green,yellow,black,最终去掉black 探针。

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捕获探针定制化合成

根据序列合成长度80-120nt的生物素修饰捕获探针。

服务优势:

1. 保密性:信息管理系统确保客户序列信息的保密;

2. 高效率:采用高通量合成平台结合自动化纯化分装,确保快速交付;

3. 定制化:根据客户研究需求自由组合靶向基因,支持多样本混合捕获;

4. 精准合成:超过99.6%的化学耦合率,低频突变并且每条探针都经过质谱检测。





多重PCR引物合成

服务优势:

1. 全自动自动定量分装工作站,定量分装均一;

2. 高质量的生产工艺和QC方法,确保多重PCR的扩增效率。

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NGS文库构建

对于illumina/MGI文库构建,bevictor伟德官网入口提供三种建库试剂盒选择,分别是:

1. 酶切建库试剂盒(一步法酶切打断建库,搭配illumina/MGI接头快速构建illumina/MGI文库);

2. 通用建库试剂盒(针对机械打断样品或者无需打断的cfDNA等,建库效率高,一步法快速构建文库,搭配illumina/MGI接头快速构建illumina/MGI文库);

3. ssDNA文库构建试剂盒(针对单链DNA、双链DNA以及单链DNA与双链DNA混合样本进行建库,可将低至10 pg样本进行超低起始量建库,建库效率高,支持构建illumina/MGI文库)。

bevictor伟德官网入口开发了针对illumina/MGI平台的全长UDI接头、截短型stubby接头、UMI接头,搭配建库试剂盒使用,轻松获得高质量的测序文库。





接头定制化合成

bevictor伟德官网入口可以根据客户需求定向研发和生产不同要求的接头序列,包括短接头、全长接头、不同污染率要求、适用于不同建库标准的专用接头等。

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合成优势:

1. 定制化合成服务和分装要求;

2. 三个级别防污染工业化生产平台满足不同防污染需求;

3. 针对NGS优化的低碱基错误率合成工艺保证接头的连接效率与数据拆分率;

4. 独有的退火体系及退火效率检测方法,可退火成品交付,有效降低操作污染。





杂交捕获技术

杂交捕获是一种靶向目标富集方法,针对目标基因设计捕获探针,捕获富集出高价值的目标基因序列进行测序,显著提高目标区域的测序深度,通过生物信息学分析,得到目标基因的变异信息。

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bevictor伟德官网入口液相杂交捕获系统由80-120 nt的DNA探针和杂交捕获配套洗液组成,结合自主研发的探针设计算法、合成制备技术与快速杂交模式可以确保探针稳定性强、纯度高、质量稳定,从而获得卓越的捕获效率和均一性。


✔ DNA探针制备组合技术可以满足灵活的Panel区域后期增加需求

✔ 杂交捕获试剂盒可以通配illumina和MGI测序平台文库


产品优势:

1. 适配快速杂交模式:可以进行常规的16~24 h杂交,也可将杂交时间缩短至0.5~4 h;

2. 支持1-12多杂,性能稳定,数据产出均一;

3. 样本兼容性广:适用于石蜡切片、组织、白细胞、cfDNA、胸腹水等各类型样本检测;

4. 自主研发的通用封闭序列可以封闭6-10 nt单双端index的文库接头;

5. 多平台匹配:适配MGI单index、双index文库、illumina文库。


使用bevictor伟德官网入口文库构建试剂盒构建出预文库,结合bevictor伟德官网入口杂交捕获试剂,即可进行高质量的靶向捕获测序。

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杂交捕获技术特点:

1 大小panel都适用;

2 相对多重PCR来说,均一性好,特异性差;

3 数据量需求略大;

4 步骤多,过程产生不同程度的DNA损失,降低了样本利用率,增加污染的风险;

5 可以检测SNP、InDel,CNV,SV,Fusion、Virus等已知或未知区域;

6 探针对错配的容忍度高,可以使用A物种的参考基因组为近缘的B物种设计探针;

7 捕获法是基于接头连接的方式构建文库,理论上可以容忍的DNA片段长度比扩增法要短(如40-60 bp古DNA);

8 适合甲基化相关的目标富集建库;

9 探针捕获适合大范围的寻找可能的致病源,如罕见病检测。





封闭剂定制化合成

bevictor伟德官网入口可以根据客户需求针对不同测序平台,不同接头类型(如TruSeq,Nextera),不同长度或带UMI接头提供定制化封闭剂合成。


✔ 独特的序列修饰确保高封阻效率

✔ 提供干粉/液体与不同分装规格等交付形式

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                bevictor伟德官网入口与不同公司封闭剂捕获效率对比图

                       bevictor伟德官网入口>Brand N>Brand i















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